据说其母是郑国人，喜欢吟唱当地流行的情歌《山有扶苏》，始皇便将两人之子取名“扶苏”，“扶苏”是古人对树木枝叶茂盛的形容，出于诗经，香草佳木之意。
秦始皇以此命名，显见对此子寄托着无限的期望。
年少时的扶苏机智聪颖，生具一副悲天悯人的慈悲心肠，因此在政见上，经常与暴虐的秦始皇背道而驰。
秦
始皇统—全国后，扶苏曾多次议政，对于治国、安定天下颇有见地。
前212年（秦始皇三十五年)，侯生、卢生等人议论皇帝，并双双逃走。
秦始皇听到消息后极为愤怒，下令御史进行追查，把460多名儒生全部“阬之咸阳”。
身为秦始皇长子的扶苏不同意父亲焚书坑懦的举措，多次上书谏议，劝阻秦始皇。
他认为“天下初定，远方黔首未集，诸生皆诵法孔子，今上皆重法绳之，臣恐天下不安。
”希望皇帝明察秋毫，赶快中止错误的举动。
扶苏的劝谏触怒了秦始皇，秦始皇偏执的认为这是扶苏性格软弱所致，于是下旨让扶苏协助大将军蒙恬修筑万里长城，抵御北方的匈奴，在大军里面锻炼。
几年的塞外征战果然使扶苏成长得与众不同，他身先士卒、勇猛善战立下了赫赫战功，敏锐的洞察力与出色的指挥才能让众多的边防将领自叹不如。
他爱民如子、谦逊待人更深得广大百姓的爱戴与推崇。
前210年（秦始皇三十七年)冬，秦始皇巡行天下，行至沙丘时不幸病逝。
秦始皇临终以前，曾为玺书召令扶苏至咸阳主持丧事并继承帝位。
但中车府令赵高和丞相李斯等人与秦始皇的小儿子胡亥阴谋篡改始皇帝的遗诏，立胡亥为太子，即皇帝位。
同时另书赐蒙恬和扶苏死，并“数以罪”。
胡亥的使者奉书到上郡，扶苏打开诏书一看，上面是指责扶苏在边疆和蒙恬屯兵期间，为人不孝、士卒多耗，无尺寸之功、上书直言诽谤，逼其自杀，看过之后知必死无疑，遂准备自杀。
蒙恬与始皇素日相交甚厚，对这份意外的诏书产生了怀疑，劝阻道：“陛下而今出巡在外，又没有立定太子，诸公子必定都虎视眈眈，暗含窥伺之心。
他委任你我监军守边，足见信任之深。
今天忽然派使者送来赐死命令，怎知不是有诈？不如提出恳请，弄清楚再死不迟。
”
那使者早就受了赵高胡亥等人的指使，只在一旁不断地催促。
扶苏一向仁孝，哪里还去想是真是假，悲伤地说：“君要臣死，父要子亡，还有什么好请求的呢？”言罢挥剑自杀。
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