商朝祖乙建都庇（今山东郓城）。
商代曾五次迁都。
《竹书纪年》载，商王仲栋自亳（山东曹县）迁于嚣”、河甲“自嚣迁于相”、祖乙“居庇（山东郓城）”、南庚“自庇迁于奄（山东曲阜）”、盘庚“自奄迁于北蒙，曰殷”。
第三次迁都没多久，又发生斗争，这时辅佐祖乙的是巫咸的儿子巫贤，巫贤在商王朝中也是一个很有才干的贤相，他向祖乙献策，将王都迁到庇（今山东鱼台附近）；因为在商王河亶甲在位时，由于得到彭、韦两个方伯的支持，商才降服了邳候，征服了兰夷和班方，使姺候也进贡称臣，因此商王朝的东部地区也就比较安宁，且庇地和诸侯彭伯所在地相近，自然条件也较好，很有利于发展农业和畜牧业，这是商朝建立后的第四次迁都。
祖乙因耿城被摧毁而迁都至庇。
祖乙在此建都18年；祖辛在此建都14年，商朝开始复兴，死后庙号为“中宗”。
后来，开甲在此建都5年；祖丁在此建都9年；南庚在此建都的第3年迁都于奄。
祖乙在位时期，将都城从相（今河南内黄）迁邢（今河北邢台）。
后因邢发生河患，于是再次迁都于庇（今山东郓城）。
商都庇城遗址在今山东郓城北肖堌堆古文化遗址。
据专家考证，此处属新石器时代的原始村落遗址。
遗址土层呈黑色，暴露有大量的磨光石器：石刀、石斧、石镰、石凿等。
遗址里还发现大量的蚌壳、鱼骨和兽骨。
各类石器类型分明，刀口锋利，眼孔钻磨均匀，骨针直径和针眼细校陶片较多，有陶鬲腿，陶罐口沿、底、腹部等，在制作上有粗细绳纹、方格纹、蓝纹等，从陶质看，有粗加砂陶、细加砂红陶、灰陶等。
该古文化遗址文化层内涵丰富，下层属于父系氏族公社晚期大汶口文化类型，上层属于先进的龙山和商周文化。
为县级文物保护单位。
曾有明、清建筑，如三皇庙、阎罗殿等，现存遗址面积3200平方米，遗址土呈灰黑色，暴露有大量的石器、陶器残片，文化内涵非常丰富。
说明至少在距今六千年前以前的大汶口文化时期，郓城境内便有先民在这里繁衍生息，是郓城历史悠久的实物例证。
《竹书纪年》：“祖乙，名滕。
二年，圮于耿，自耿迁于庇。
三年，命卿士巫贤。
八年，城庇。
十五年，命邠侯高圉。
十九年，陟。
祖乙之世，商道复兴，庙为中宗。
”
《竹书纪年》：“祖辛，名旦。
元年戊子，王即位，居庇。
十四年，陟。
”
《竹书纪年》：“开甲，名逾。
元年壬寅，王即位，居庇。
五年，陟。
”
《竹书纪年》：“祖丁，名新。
元年丁未，王即位，居庇。
九年，陟。
”
《竹书纪年》：“南庚，名更。
元年丙辰，王即位，居庇。
三年，迁于奄。
六年，陟。
”
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