但当他们的兵舰驶近海岸时，却遭岸上台湾守军大炮的猛烈轰击。
日军才知在基垄淡水登陆不易。
5月28日，日本侵略军近卫师团在陆军中将北白川宫能久亲王统率下，随同由海军少将东乡平八郎指挥的舰从，从琉球中城湾出发，进至台北海口。
次日，日军采取声东击西的战术，以军舰佯攻金包里，而以主力掩护登陆部队驶入三貂角海面。
1895年月29日，日军一部在三貂角登陆。
第二天，日军主力又绕至基隆东面的澳底登陆。
本来基隆方面负责防守的统率是杨歧桢。
三天前他率所部内渡，使这一带的守备诸营无主帅统领，防守兵力也大力削弱。
日军以两个大队的兵力由顶双溪向三貂岭推进。
当地只有零星驻军，虽经阻击，终因敌众我寡，不支而退。
31日，日军一部进犯瑞芳镇，广勇吴国华以竹林为掩护，猛烈射击，打得敌人狼狈而逃。
日军先头部队60人在虎仔山附近的核仔庄登陆后，在盐寮架起便桥，大队山盐寮登陆。
防守该地的曾喜照部二营，士兵大多新募入伍，“成军甫三日，遇敌不战溃”，日军登陆时，澳底守军营官曾喜照遇敌不敢战，即率营逃跑。
日军顺利登陆。
当晚，日军越过土岭，到达顶双溪。
三貂岭之战
基隆与澳底中间隔着三貂岭。
三貂岭是台北第一高山，位置重要，道路险峻，易守难攻。
过岭，分大小两道，大道通瑞芳，达基隆；小道通吴埕，达八堵。
守卫三貂岭的一营防军见曾喜照二营溃败而来，于是也一哄而散。
致使日军毫无阻挡地进入了三貂岭。
31日下午，已经越过三貂岭到达岭背的日军前锋，与自基隆赶来的吴国华军相遇，吴国华军进击，一名日军军官被击毙，日军退却。
吴率部追至岭巅，日军退至半山。
这时自基隆率营前来增援的包干臣，见日军退却并遗下枪械、尸体，就将敌首级割下，冒充己功回基隆报大捷。
在三貂岭上追击日军的吴国华闻听后大怒，舍弃日军，率队急弛下岭。
吴国华率部紧随包干臣军队之后，两部回到基隆后，争功不已。
三貂岭遂弃而不守。
日军见追军撤退，于是夺下三貂岭，逼近基拢
这实在是一件荒唐至极的事情，不过恰好也反映了军队的腐败。
日军在进攻基隆的过程中，途径瑞芳镇，受到守军的顽强阻击。
唐景崧见基隆守军各不相统，派“民主国内务大臣”余明震率黄翼德一部前去督战。
守军与日军正酣战之际，忽接唐景崧电报，令黄翼德率部速回。
奋战各营土气由此大受影响。
余明震急返台北问唐景崧，唐景崧竟茫然不知。
经查，才知是黄翼德自己让人以唐景崧的名义干的。
真相大白后，唐景崧竟不敢对其绳之以法。
军纪败坏至此，军队也就难有斗志。
6月1日，日军再扑瑞芳镇。
吴国华部接战不力，守备刘燕督率炮队，从瑞芳镇西面土山上发炮，击退了敌人。
次日，日军调集大队兵马，分路进攻瑞芳。
日军第一中队进至瑞芳西面高地，受到守备刘燕部炮兵的阻击，给进攻日军以较大杀伤。
日军第二、三中队绕过高地，向瑞芳镇进攻，守军以围墙和民房为掩护，英勇抗击日军。
日方自己承认，死伤很大。
防军统领张兆连冒雨赶赴战场，亲自带队冲锋，歼敌多名，后敌军增援，形成了包围圈，张兆连右腿负伤，左右亲兵大都战死，瑞芳镇终告失守。
6月3日，日军集中登陆部队，分三路围攻台湾北部的重要港口基隆，日舰也从海上轰击，当时驻守基隆的是提督张兆连部四营、通判张道义部二营。
战斗从10时50分开始，守军力薄，且战且退。
下午，日军攻入基隆港。
狮球岭失守
狮球岭地处基垄台北间，为通达台北的重要关隘。
本来狮球岭由台湾绅士林朝栋率所部驻扎。
中法战争期间，林朝栋率乡勇曾在狮球岭阻击法军，使法军未能进攻台北。
林部皆为台湾人，保卫家乡观念强烈，且训练有素，在诸军中颇有声望。
但唐景崧对当地士绅颇有疑忌，将林朝栋部队调往台中，派刚刚招募组军的粤勇驻防。
基隆失陷后，又有当地义勇撤至狮球岭助防。
粤勇素与当地人不和，这怎么能打好仗呢？
6月4日上午，日军趁大雨中守军疏于防备时，偷袭上山。
直到逼近了，才为守军发觉。
粤勇迎敌，而在其后的义勇则后撤准备择地攻击。
粤勇认为义勇畏敌不前，就开枪还击。
义勇认为粤勇叛变，也开枪还击。
于是自相残杀，阵势大乱。
日军趁机进攻，守军败退。
狮球岭失守。
在狮球岭局势紧张之际，有人建议调林朝栋支援。
唐景崧紧急发电催林朝栋北上。
林朝栋拒不回电。
关键时刻唐景崧措置无方，致使人心离散。
大敌当前，林朝栋仍记个人恩怨，怎能同心协力抵抗日军的进攻？
基垄狮球岭接连失守，溃兵涌入台北城。
听说日军将至，城中官民乱成一团。
自基隆退回的李文奎领着溃兵冲进“总统府”，逼唐景崧出战。
唐景崧见情况不妙，慌称同意，稳住了李文奎。
随即带几名随从自后门溜出，混在难民群中逃出台北，连夜逃至淡水。
6月5日，唐景崧挤上已有众多散兵的德国商船，随从搬运8箱白银上船。
炮台上的兵勇看见白银装上船，即开炮阻止。
商船中炮，船上十余名士兵被打死。
直到白银被卸下，商船才在德国兵舰的护卫下驶离港口。
唐景崧的逃走，使台北一带局面更加混乱，城中难民四处逃散。
城内的散兵、乱民群起抢劫。
溃兵听说府库有白银百万两，争相破门抢劫，为争抢又互相枪击。
溃兵还放火焚烧巡抚衙门。
城中积尸遍地，哭声震天。
台北的混乱局面使住在当地的外国人十分害怕。
为使他们的利益不致受到损害，法德两国一面调海军上岸保护，一面与基隆日军联系。
这时，一些台湾当地的士绅竟也然商议起让日军尽快进入台北城维持秩序，鹿港人辜显荣自告奋勇去基隆接引日军。
当日军听到辜显荣的报告后，还未敢轻信。
这时又有德国商人等传来消息。
日军还是怕中埋伏，派出一中队骑兵到台北城侦察。
又过了两天，即6月7日，日军大队才开入城内。
当时，“民主国”大部散兵已撤往新竹，城内居民能离开的则扶老携幼，渡海西去。
没能走掉的则万分恐怖。
基垄台北城相继陷落，“总统”唐景崧潜渡，驻守台中的“副总统”丘逢甲、林朝栋皆无心再战。
6月9日，丘逢甲解散义勇，挟10万两饷银仓皇内渡广东。
林朝栋也率其一部西渡漳州。
不少府县官员及兵将也纷纷离台，“民主国”在北部、中部的“政权”实际上已经完结。
隆恩埔战役
7月12日，日军近卫师团步兵第三联队第二大队第六中队特务曹长樱井茂夫率领之“水路运送队”共35名，自台北沿大嵙崁溪水路运送粮食，当夜停泊于三角涌隆恩埔。
7月13日清晨五时，船队解缆往大嵙崁航行，才前进数百米，便遭遇到苏力、苏竣林久远、陈小埤等人为首的二百余名三角涌抗日义勇军奇袭。
经数小时的激烈战斗后，日军水路运送队几乎全队覆灭，仅有4名兵卒幸免脱逃。
三角涌战役
三角涌是台北附近的一个村庄，地形险要，当地民众具有反抗外国入侵的斗争传统。
日军占领台北后，又逃来了大批难民，他们共同抗日，同仇敌忾，士气旺盛。
而台湾光复后三峡许多老者的说法为：三角涌客家义勇军接获抗日义勇军通知，得知日军以水运方式运输后勤弹药与食物会经过今三峡与莺歌交接触的流域，于是，客家义勇军结合部分隆恩埔原住民配以长刀、自制竹刀与弓箭在南靖庄埋伏。
7月12日清晨4点多，在发现日军水路运送队40名士兵后，客家义勇军躲在暗处先以弓箭射击，部分日军见状持枪反击，但天色昏暗无法得知埋伏的义勇军的确切位置，加上部分日本士兵中箭而纷纷弃船逃离，而逃亡的日本士兵登岸后往一片树丛（今台北大学校园）移走，将近百余人的义勇军纷纷持大刀等武器开始杀红了眼追击日本士兵，并在今台北大学校内近身短兵厮杀，日本士兵兵力单薄不敌百余人义勇军，一一被乱刀砍死。
义勇军商议后将日本士兵埋葬于此，藉以湮灭证物以防日军报复，然而因为树丛掩蔽仍有数名日本兵幸免脱逃。
事后日军得知此事，才有后来的三角涌规模大屠杀百姓的事件以作报复。
三角涌大屠杀事件
7月11日，一支由25人和6艘运输船组成的日军水路运粮队，由台北出发，12日到达三角涌。
13日晨，日军运粮队遭到义军袭击。
数百名义军夹河射击敌船，击毙运粮队日酋樱井曹长，除三人逃脱外，其余全部被击毙。
15日，由山本小队长率领的一支21人骑兵队，来三角涌侦察，找村民引路，被引上盘杭头狭路。
正疑惑间，忽然枪声四起，响彻山林，伪装成农民模样的义军，拿出预先藏好的步枪，从四面八方向日军射击，宁静的山河顿时草木皆兵。
日军被迫后退，但无法摆脱义军的包围，只有三骑侥幸逃脱，其余全部被歼。
日寇恼羞成怒，为了报复，22日又纠集三个支队的兵力，由第二旅团长山根信成少将指挥，包围三角涌，杀气腾腾，企图一举消灭那里的抗日力量。
三角涌的义军和当地民众，在敌人必经的道路上，挖陷阱、设埋伏，用机动灵活的作战方法抗击日军。
经过两天激战，义军壮烈牺牲数百人，三角涌沦入敌手。
日军实行了灭绝人性的大屠杀，烧毁了数以千计的民房。
三角涌义军和民众的英勇抗日行动，充分显示了台湾人民不畏强暴、誓死抵抗侵略的不屈不挠的斗争精神。
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